Согласно новой схеме, ряд действующих отделов Минздрава будут укрупнены до статуса управлений. В министерстве появятся отдельные управления организации медицинской помощи женщинам и детям, управления информационных технологий, а также референтуры и работы с обращениями граждан. При этом три базовых блока — планово-экономическое управление, управление организации медпомощи и профилактики, а также кадровой политики и правового обеспечения — сохранят свои позиции, но изменят внутреннее наполнение.

В обновленной структуре ведомства также обособят мобилизационный отдел, отделы инфраструктурного развития, кадровой политики и медобразования, финансового контроля, анализа и стратегического планирования, лекарственного обеспечения и реализации нацпроектов.

Изменения вносятся в прежнюю структуру Минздрава, которая была утверждена постановлением главы региона от 11 ноября 2024 года № 350.